老旧厂房翻新过程中，结构改造常常面临一系列复杂的挑战，这些难点不仅涉及到建筑本身的结构问题，还包括现代使用需求的适应与满足。
老旧厂房的结构改造常常面临原有建筑材料老化、结构强度不足等问题。许多老厂房采用的是砖木结构或钢筋混凝土结构，经过多年的风吹雨打和使用磨损，材料的老化现象严重。特别是木材部分易被虫蛀或腐蚀，钢筋混凝土部分则可能因钢筋锈蚀而丧失强度，造成承重能力下降。在改造过程中，需要进行详尽的结构检测与评估，以确保改造方案的安全性和可行性。

原有结构的空间布局和承重体系往往不能满足现代使用功能的要求。老旧厂房通常设计为大跨度的单层或多层空间，其内部隔墙和支撑结构多为承重墙或柱网。改造时若需改变空间布局或增加新功能，例如增加楼板或改变楼层用途，必须谨慎考虑对原有承重体系的影响。这种情况下，常常需要加固原有结构，或者增设新型支撑结构，如钢架或钢筋混凝土柱，来替代或补充原有承重体系。
在老旧厂房翻新中，结构改造还需应对不符合现行建筑规范的问题。许多老旧厂房在建造时依据的是旧标准，现如今建筑规范和安全标准发生了较大变化。例如，抗震要求更高、消防疏散要求更严格等。为了达到现代规范标准，往往需要对结构进行加固改造，例如增加剪力墙、抗震支撑等，以提高结构整体的抗震性能。
老旧厂房的改造需要在保护其历史价值与文化特色的前提下进行。保留建筑的原有特色和风貌，特别是在结构改造时，需考虑如何巧妙地结合现代结构加固技术与传统建筑元素，避免过度破坏原有建筑的历史风貌。因此，在实际操作中，不仅需要结构工程师的专业技术，还需要建筑师与历史保护专家的紧密合作，以寻求一个平衡点。